يسعى مكتب البحث العلمي إلى تحقيق الأهداف التالية :

1-     إجراء البحوث وتوجيه الباحثين والعلماء والمبدعين لدراسة القضايا العلمية في مجالات العلوم الطبية .

2-     نشر ثقافة البحث العلمي لبناء قاعدة علمية قادرة على تطوير المجتمع .

3-     تشجيع البحث العلمي ، والعمل على الرفع من مستواه وتطوير أساليبه من خلال الهيئة والمراكز البحثية ، ودعمه في جميع المؤسسات المعنية به .

4-     دعم الباحثين ومنحهم الحوافز المادية والمعنوية وتوفير المناخ العلمي المناسب لهم وتشجيعهم على خوض غمار البحث العلمي .

5-     المساهمة في خلق الترابط بين المؤسسات البحثية والتعليمية وتنسيق جهودها للدفع بالبحث العلمي والتعليم العالي والنهوض بها .

6-     ربط أواصر التعاون مع المؤسسات البحثية والعلمية الإقليمية والدولية .